鄂尔多斯国际机场运营航线52条，通达国内城市：北京、杭州、天津、成都、郑州、深圳、广州、三亚、上海、太原、济南、西宁、无锡、西安、青岛、南昌、烟台、合肥、石家庄、扬州、徐州、武汉、佛山、珠海、长沙、南京、海口、昆明、厦门、重庆、赤峰、阿拉善左旗、通辽、济宁、沈阳、哈尔滨、长春、锡林浩特、乌兰浩特、海拉尔、博鳌、贵阳、兰州，国际/地区城市:蒙古乌兰巴托、泰国曼谷、马来西亚吉隆坡、香港共计47个通航城市。